Por quê?

• Pra ciência

• Pra você

Ferramentas

• R e RStudio (ok)

• Github

• knitr e rmarkdown

• LaTeX

Fluxo de trabalho

1. Coleta

2. Análise

3. Comunicação

Dicas

1. Documente tudo!

2. Tudo é um arquivo (de texto).

3. Todos os arquivos devem ser legíveis (por humanos).

4. Relacione explicitamente seus arquivos.

5. Tenha um plano para organizar, armazenar e disponibilizar seus arquivos.

Trabalhando com projetos

Gerenciamento de arquivos: caminhos relativos e não absolutos

• Onde guardar seus projetos?

Passo-a-passo

1. Repositório: Criação de repositório do projeto no Github

2. .Rproj: Criação do Projeto no RStudio

3. Commit: Editando e “Commitando” as mudanças no código

4. Push: Subindo os commits para o Github

5. Pull: Baixando o estado atual do projeto

Caso tenha dificuldade

Beatriz Milz - RLadies

Curso R

Rode seus pacotes!

lapply(c("tidyverse","haven","lubridate",
         "janitor","readxl",
          "stringr", "magrittr","srvyr",
         "survey"),require,character.only=T)

onde estamos?

O que é?

• Comunicar com os tomadores de decisão,

  – que querem se concentrar nas conclusões, não no código por trás da análise.

• Colaborar com outros cientistas de dados,

  – interessados em suas conclusões e como você as alcançou (ou seja, o código).

• um caderno de laboratório moderno,

  – onde você pode anotar não apenas o que fez, mas também o que pretende.

O R Markdown integra vários pacotes R e ferramentas externas. então, use o cheatsheets:

R Markdown Cheat Sheet

R Markdown Reference Guide

Lógica, instalação e recursos adicionais

• Pandoc e knitr

• LaTeX

O básico

Cabeçalho

– opções e possibilidades

Escrita

Chunks

– opções – nomes

Formatos de saída

Saídas

Documentos estáticos

Documentos Interativos

Dashboards

Apresentações

Livros

Sites

Modelos

Site do RMarkdown

IMPORTANTE!

Galeria para replicação

Documentos

• documentos HTML para publicar na web

• documentos PDF para impressão. Example Code

• documents Microsoft Word para fluxos de trabalho no Office

• Documentos de estilo Tufte

Documentos Interativos

• Combine R Markdown with htmlwidgets or the shiny package to make interactive documents.

• Add interactive graphics with htmlwidgets, such as the leaflet map widget.

• Embed htmlwidgets such as dygraphs and datatables directly into your reports.

• Shiny components and htmlwidgets will work in any HTML based output, such as a file, slide show or dashboard.

Dashboards

• Usar flexdashboard para criar dashboards com gauges e value boxes.

• Adicionar gráficos interativos a um dashboard com htmlwidgets.

• Organizar dashboards em um storyboard.

Apresentações

• Criar slides pdf slides com Beamer.

• Create slides HTMLcom Slidy.

• Create slides HTMLcom ioslides.

• Create slides HTMLcom reveal.js.

Livros

O próprio Cookbook

Sites

R Markdown makes it easy to build webpages straight from .Rmd files.

• The R Markdown website is itself built with R Markdown. Example Code.

• flexdashboard extends R Markdown to make administrative dashboards. Its website is also built from R Markdown. Example Code.

• Bookdown extends R Markdown to make books. Its website is built with R Markdown and CSS styling. Example Code.

• profvis provides profiling tools for R code, as well as a website made with R Markdown. Example Code.

Modelos

• The JSS article template in the rticles package formats an R Markdown document to meet the style guidelines of the Journal of Statistical Software. Example Code

• The rjournal article template in the rticles package formats an R Markdown document to meet the style guidelings of the R Journal. Example Code

• The skeleton template is one of several provided in Bob Rudis’ markdowntemplates package. Example Code

• Steve Miller’s CV template formats an R Markdown file into a Curriculum Vitae (CV). Example Code

Paper em pdf

RAP - Usando bibliografia

PDAD

Relatório em html

Compras públicas

ANIPES

Slides em html

Usando CSS

Apresentação COVID

Reprodutibilidade

• Boas práticas

• Projetos

• Git/github